CGHcall : calling aberrations for array CGH tumor profiles

M.A. Wiel, van de, Kyung In Kim, S.J. Vosse, W.N. Wieringen, van, S.M. Wilting, B. Ylstra

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

174 Citaten (Scopus)

Samenvatting

CGHcall achieves high calling accuracy for array CGH data by effective use of breakpoint information from segmentation and by inclusion of several biological concepts that are ignored by existing algorithms. The algorithm is validated for simulated and verified real array CGH data. By incorporating more than three classes, CGHcall improves detection of single copy gains and amplifications. Moreover, it allows effective inclusion of chromosome arm information.
Originele taal-2Engels
Pagina's (van-tot)892-894
TijdschriftBioinformatics
Volume23
Nummer van het tijdschrift7
DOI's
StatusGepubliceerd - 2007

Vingerafdruk Duik in de onderzoeksthema's van 'CGHcall : calling aberrations for array CGH tumor profiles'. Samen vormen ze een unieke vingerafdruk.

Citeer dit