• 2154 Citaties
19962020

Research output per year

Als u wijzigingen in Pure hebt gemaakt, zullen deze hier binnenkort zichtbaar zijn.

Persoonlijk profiel

Quote

Molecular simulations can act as a digital microscope. They allow us to observe how simple interactions between atoms and molecules give rise to intricate dynamics of molecular systems.

Research profile

Bart Markvoort is assistant professor in the Computational Biology group of the TU/e department of Biomedical Engineering. His research focuses on molecular simulations of self-assembly and self-organization processes in biologically relevant systems, with focus on both method development and application. His current research projects include molecular dynamics simulations of phospholipid membranes, proteins and DNA, as well as the modeling of supramolecular (co)polymerizations and nanoparticles using Monte Carlo techniques. He is also active in the fields of synthetic biology, DNA nanotechnology, bioinformatics, and multi-scale modeling.

Academic background

Bart Markvoort studied Applied Physics at Eindhoven University of Technology (TU/e, The Netherlands), where he obtained his Master's degree in the Theoretical Physics group on the subject of small angle x-ray scattering on asphaltenes. He then started PhD research in the Parallel Systems group of the TU/e department of Mathematics and Computer Science on the application of wavelets in parallelized density functional theory calculations. In 2006, he obtained his PhD for his thesis 'Towards Hybrid Molecular Simulations' under the supervision of professors Peter Hilbers and Thijs Michels. He then was appointed in his current position as assistant professor in the Computational Biology group of the TU/e, heading the molecular simulations subgroup. As of 2010 he is also a member of the Institute for Complex Molecular Systems at TU/e.

Vingerafdruk Verdiep u in de onderzoeksgebieden waarop A.J. (Bart) Markvoort actief is. Deze onderwerplabels komen uit het werk van deze persoon. Samen vormen ze een unieke vingerafdruk.

  • 9 Soortgelijke profielen

Netwerk Recente externe samenwerking op landenniveau. Duik in de details door op de stippen te klikken.

Onderzoeksoutput

Proximity-induced caspase-9 activation on a DNA origami-based synthetic apoptosome

Rosier, B., Markvoort, A. J., Gumi Audenis, B., Roodhuizen, J., den Hamer, A., Brunsveld, L. & de Greef, T. F. A., 1 mrt 2020, In : Nature Catalysis. 3, 3, blz. 295-306 12 blz.

Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

  • 6 Downloads (Pure)

    Counterion-dependent mechanisms of DNA origami nanostructure stabilization revealed by atomistic molecular simulation

    Roodhuizen, J., Hendrikx, P. J. T. M., Hilbers, P. A. J., de Greef, T. & Markvoort, B., 10 sep 2019, In : ACS Nano. 13, 9, blz. 10798-10809 12 blz.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

    Open Access
    Bestand
  • 18 Downloads (Pure)

    Detailed approach to investigate thermodynamically controlled supramolecular copolymerizations

    de Windt, L. N. J., Kulkarni, C., ten Eikelder, H. M. M., Markvoort, A. J., Meijer, E. W. & Palmans, A. R. A., 8 okt 2019, In : Macromolecules. 52, 19, blz. 7430-7438 9 blz.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

    Open Access
    Bestand
  • 2 Citaten (Scopus)
    12 Downloads (Pure)

    Equilibrium model for supramolecular copolymerizations

    ten Eikelder, H., Adelizzi, B., Palmans, A. & Markvoort, B., 1 aug 2019, In : Journal of Physical Chemistry B. 123, 30, blz. 6627-6642 16 blz.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

    Open Access
    Bestand
  • 4 Citaten (Scopus)
    24 Downloads (Pure)

    Mass-balance models for scrutinizing supramolecular (co)polymerizations in thermodynamic equilibrium

    ten Eikelder, H. M. M. & Markvoort, A. J., 17 dec 2019, In : Accounts of Chemical Research. 52, 12, blz. 3465-3474 10 blz.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

    Open Access
    Bestand
  • 9 Downloads (Pure)

    Cursussen

    Moleculaire modellering

    1/09/15 → …

    Cursus

    OGO Genexpressie

    1/09/13 → …

    Cursus

    Programmeren en genomics

    1/09/15 → …

    Cursus

    Project Computational biology

    1/09/1431/08/20

    Cursus

    Knipsels

    Resolution Definition Biology

    A.J. Markvoort & T.F.A. de Greef

    26/04/17

    1 item van Media-aandacht

    Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar

    What Does Atp Mean In Biology

    A.J. Markvoort & T.F.A. de Greef

    26/04/17

    1 item van Media-aandacht

    Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar

    Definition Of Cohesion In Biology

    A.J. Markvoort & T.F.A. de Greef

    26/04/17

    1 item van Media-aandacht

    Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar

    Scriptie

    (Ultra-) Small angle X-ray scattering on asphaltenes : mathematical modelling and physical conclusions

    Auteur: Markvoort, A. J., 30 apr 1997

    Begeleider: Michels, M. (Afstudeerdocent 1) & Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master

    Bestand

    Cationic stabilization of DNA origami investigated through atomistic simulations

    Auteur: Hendrikx, P., 29 nov 2018

    Begeleider: Roodhuizen, J. (Afstudeerdocent 1), Markvoort, B. (Afstudeerdocent 2), de Greef, T. (Afstudeerdocent 2) & Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master

    Cholesterol and bio-membranes influence on membrane dynamics and stability

    Auteur: van den Heuvel, F., 28 feb 2005

    Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), Markvoort, A. (Afstudeerdocent 2), Pieterse, K. (Afstudeerdocent 2), van Steenhoven, A. (Afstudeerdocent 2) & Kuijpers, N. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master

    Dynamic behaviour of the ß2-adrenergic receptor: approach and study using molecular dynamics

    Auteur: Spijker, P., 31 dec 2004

    Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), Meijer, E. (Afstudeerdocent 2), van Santen, R. (Afstudeerdocent 2), Vaidehi, N. (Externe persoon) (Externe coach), Merkx, M. (Afstudeerdocent 2), Pieterse, K. (Afstudeerdocent 2) & Markvoort, A. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master

    Mapping the homunculus in sensorimotor cortex using fMRI

    Auteur: Bakker, C., 28 sep 2017

    Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Markvoort, A. (Afstudeerdocent 2) & Schellekens, W. (Externe persoon) (Externe coach)

    Scriptie/masterproef: Master