• Groene Loper, Building 15, Gemini-South 2.106, Secretary Rina van Dijck-Postma

    5612 AZ Eindhoven

    Nederland

Scripties/Masterproeven

3D medical image segmentation with labeled and unlabeled data using autoencoders

Auteur: Sital, C., 28 nov 2019

Begeleider: Raaijmakers, A. (Afstudeerdocent 1), Weese, J. (Externe persoon) (Externe coach) & Brosch, T. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

A computational biology framework: a data analysis tool to support biomedical engineers in their research

Auteur: Beishuizen, T., 29 nov 2018

Begeleider: Bosnacki, D. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2), Fletcher, G. (Afstudeerdocent 2) & Vanschoren, J. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Analyzing the relation between brain lesions and short association fibers using diffusion MRI

Auteur: Kamps, J., jun 2017

Begeleider: Sepasian, N. (Afstudeerdocent 1), Fuster, A. (Afstudeerdocent 2) & Pluim, J. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Automated spinous process segmentation in X-ray images using convolutional neural networks

Auteur: Roodhorst, S., 17 dec 2018

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1) & Walsum, van, T. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Brain blood perfusion and white matter integrity in accelerated cognitive ageing patiens with epilepsy

Auteur: Stevens, J., 31 okt 2019

Begeleider: Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 1), Pluim, J. (Afstudeerdocent 2), Aldenkamp, A. (Afstudeerdocent 2), Zinger, S. (Afstudeerdocent 2), Mestrom, R. (Afstudeerdocent 2) & Bernas, A. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Canonical correlation analysis on microbial and metabolite data of individuals with metabolic syndrome

Auteur: van der Stam, J., 19 jan 2019

Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2), Veta, M. (Afstudeerdocent 2), Levin, E. (Externe persoon) (Externe coach) & Nieuwdorp, M. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Causal candidate genes identification for familial hypercholesterolemia family based on whole-genome sequencing

Auteur: Wang, Q., 31 aug 2017

Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2), Hovingh, K. (Externe persoon) (Externe coach), Bosnacki, D. (Afstudeerdocent 2) & Veta, M. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Clustered tumor phenotypes and resectability prediction for PDA using radiomic feature analysis

Auteur: Janse, M. H., 27 sep 2018

Begeleider: de With, P. (Afstudeerdocent 1), Pluim, J. (Afstudeerdocent 2), Zinger, S. (Afstudeerdocent 2) & Hermans, J. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Content based CT retrieval for pulmonary nodules: deep metric learning based feature extraction

Auteur: Aerts, T., 28 feb 2019

Begeleider: Menkovski, V. (Afstudeerdocent 1), Holenderski, M. (Afstudeerdocent 2) & Veta, M. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Bestand

Convolutional neural networks for detection of metastases in patients diagnosed with breast cancer

Auteur: Nijhof, T., 25 jan 2018

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1)

Scriptie/masterproef: Master

CycleGAN for coronay vessel segmentation

Auteur: van den Bosch, P., 29 aug 2019

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Bovendeerd, P. (Afstudeerdocent 2), Veta, M. (Afstudeerdocent 2) & Oliván-Bescós, J. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Deep learning approaches for prostate cancer detection and grading in Bi-parametric MRI

Auteur: de Vente, C., 29 aug 2019

Begeleider: Veta, M. (Afstudeerdocent 1), Vos, P. (Externe persoon) (Externe coach), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2) & Pluim, J. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Deep learning for the detection of cerebral microinfarcts in MR images

Auteur: Volmer, L., 31 okt 2019

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Veta, M. (Afstudeerdocent 2) & van Riel, N. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Diffusion tensor residuals as a potential biomarker for brain tissue damage

Auteur: van Rijn, A., 23 apr 2020

Begeleider: Pluim, J. P. (Afstudeerdocent 1), Leemans, A. L. (Externe persoon) (Externe coach) & De Luca, A. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Effect of SNR and user-defined tractography parameters on group analyses of diffusion tensor metrics

Auteur: Vos, I., 27 feb 2020

Begeleider: Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 1), Leemans, A. L. (Externe persoon) (Externe coach) & De Luca, A. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

From hyperspectral data cube to tumor prediction

Auteur: Weijtmans, P., 20 jun 2019

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1) & Shan, C. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

In vivo assessment of the subchondral bone plate in patients with knee osteoarthritis using second generation HR-pQCT

Auteur: van Mourik, M., 28 mrt 2019

Begeleider: Ito, K. (Afstudeerdocent 1), van Rietbergen, B. (Afstudeerdocent 2), Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 2), van den Bergh, J. P. (Externe persoon) (Externe coach), Geusens, P. P. (Externe persoon) (Externe coach) & Wyers, C. E. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Mapping the homunculus in sensorimotor cortex using fMRI

Auteur: Bakker, C., 28 sep 2017

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Markvoort, A. (Afstudeerdocent 2) & Schellekens, W. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Meta-learning for medical image segmentation

Auteur: van Sonsbeek, T., 19 dec 2019

Begeleider: Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 1), Pluim, J. P. (Afstudeerdocent 2) & van Riel, N. A. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Neuromelanin imaging using magnetization transfer MRI at 7T

Auteur: van Boxel, S., 31 aug 2017

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Priovoulos, N. (Externe persoon) (Externe coach), Jacobs, H. (Externe persoon) (Externe coach) & Ivanov, D. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Open implementation and evaluation of transverse oscillations using high frame rate single acquisitions

Auteur: van Hees, R., 21 jun 2018

Begeleider: van de Vosse, F. (Afstudeerdocent 1), Lopata, R. (Afstudeerdocent 2), Arabul, M. (Afstudeerdocent 2), Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 2) & Belt, H. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Primary tumor origin classification of lung nodules in spectral CT using transfer learning

Auteur: Hesse, L., 20 jun 2019

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), de Jong, P. A. (Externe persoon) (Externe coach), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2) & Eduati, F. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Real-time fMRI: multi-echo acquisition as a method for physiological confound reduction

Auteur: Versteijlen, M., 29 aug 2019

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 2) & van Rietbergen, B. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Real-time fMRI for therapeutic applications: investigation into distortion and motion correction

Auteur: van der Burg, C., 30 aug 2018

Begeleider: Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 1) & Lamerichs, R. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Re-referencing methods for high-density electrocorticographic signals: evaluating alternatives of common average re-referencing

Auteur: Pilmeyer, J., 29 nov 2018

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Eduati, F. (Afstudeerdocent 2), Freudenburg, Z. (Externe persoon) (Externe coach) & Branco, M. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Respiratory correlated four-dimensional T2-weighted Turbo Spin Echo MRI using Cartesian-Spiral K-space sampling trajectory

Auteur: Akdag, O., 28 nov 2019

Begeleider: Pluim, J. P. (Afstudeerdocent 1), Raaijmakers, A. (Afstudeerdocent 2), Loerakker, S. (Afstudeerdocent 2) & Tijssen, R. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Retinal structure recognition in images reconstructed from A-Scans of an OCT-probe

Auteur: Weijers, R., 23 feb 2017

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), ter Haar Romenij, B. (Afstudeerdocent 2), Steinbuch, M. (Afstudeerdocent 2), van de Molengraft, M. (Afstudeerdocent 2) & Douven, Y. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Segmentation and classification of skin cancer in histopathological whole slide images

Auteur: van Zon, M., 28 nov 2019

Begeleider: Pluim, J. P. (Afstudeerdocent 1), Veta, M. (Afstudeerdocent 2), Eduati, F. (Afstudeerdocent 2), van Diest, P. J. (Externe persoon) (Externe coach) & Stathonikos, N. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Segmentation techniques for the visible mouse

Auteur: Panday, V., 30 jun 2003

Begeleider: ter Haar Romenij, B. (Afstudeerdocent 1), van den Bosch, P. (Afstudeerdocent 2) & Strijkers, G. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Study on the excitability of the brain and its relation to functional MRI connectivity in patients with focal epilepsy

Auteur: Meijer, A., 23 feb 2017

Begeleider: Ossenblok, P. (Afstudeerdocent 1)

Scriptie/masterproef: Master

Tackling B1+ inhomogeneity problems at high field MRI to be able to predict neoadjuvant chemotherapy response in breast cancer patients

Auteur: Elschot, E., 30 jan 2020

Begeleider: Raaijmakers, A. (Afstudeerdocent 1), Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 2), Eduati, F. (Afstudeerdocent 2), Wijnen, J. P. (Externe coach) & van den Wildenberg, L. (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Bestand

The effect of resolution on bone mechanical properties in the human distal radius assessed by finite element analysis: a comparison between HR-pQCT and QCT resolution scans and between HR-pQCT generations

Auteur: Voermans, A., 29 mrt 2018

Begeleider: Ito, K. (Afstudeerdocent 1), van Rietbergen, B. (Afstudeerdocent 2), van den Bergh, J. P. (Externe persoon) (Externe coach), Arts, J. (. (Afstudeerdocent 2), Pluim, J. (Afstudeerdocent 2) & de Jong, J. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master

Towards respiratory motion correction in PET through non-rigid MRI registration guided by ultrasound synchronization

Auteur: Belsley, G., 30 aug 2018

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1) & Madore, B. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

Vessel feature learning using a foveal fully convolutional neural network

Auteur: Tio, D., 19 dec 2019

Begeleider: Breeuwer, M. (Afstudeerdocent 1), Pluim, J. P. (Afstudeerdocent 2), van de Vosse, F. N. (Afstudeerdocent 1) & Weese, J. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

X-ray image denoising using deep-learning

Auteur: Giurgia, M., 29 aug 2019

Begeleider: Pluim, J. (Afstudeerdocent 1), Markvoort, B. (Afstudeerdocent 2), Veta, M. (Afstudeerdocent 2), Oliván-Bescós, J. (Externe persoon) (Externe coach) & Rongen, P. (Externe persoon) (Externe coach)

Scriptie/masterproef: Master

X-ray scatter correction using sinusoidal modulation

Auteur: Pieters, M., 30 mrt 2017

Begeleider: Ruijters, D. (Afstudeerdocent 1) & Pluim, J. (Afstudeerdocent 2)

Scriptie/masterproef: Master