• Groene Loper, Building 15, Gemini South (room 2.106)

    5612 AZ Eindhoven

    Nederland

Organisatieprofiel

Introductie / missie

Constructing computational models to improve the knowledge of diseases, biomedical processes and structures

Highlighted phrase

Describing, understanding and ultimately controlling life's processes

Over de organisatie

The research group Computational Biology develops computational models that help to obtain qualitative and quantitative knowledge of diseases, biomedical processes and structures. The computational models are developed based on a thorough understanding of molecular modeling methods, data analysis techniques,  machine learning, systems biology, and parameter estimation techniques. Next to data obtained through collaborations and partnerships with other university groups, companies and hospitals, within the Synthetic Biology arena data is also achieved by own experiments. Topics of research are, amongst others, biomembranes, protein interactions, complex biochemical networks, and diseases like metabolic syndrome, diabetes mellitus and cancer. The group also puts efforts in enhancing the shift from ‘describing’ life’s processes to ‘understanding’ them and ‘capturing’ them in validated predictive models, and even ‘managing’ or ‘controlling’ them in real life. Research themes of the group are Molecular Simulations, Systems Biology, Synthetic Biology, Bioinformatics and Mathematical Modeling.

Vingerafdruk Verdiep u in de onderzoeksgebieden waarop Computational Biology actief is. Deze onderwerplabels komen uit het werk van de leden van deze organisatie. Samen vormen ze een unieke vingerafdruk.

  • Netwerk Recente externe samenwerking op landenniveau. Duik in de details door op de stippen te klikken.

    projecten

    NWO/Complexity/MATRyOSka

    van Riel, N. A. W., Aktas, G., O'Donovan, S. D., Arts, I. C. W. & Afman, L.

    1/10/1731/12/22

    Project: Onderzoek direct

    Onderzoeksoutput

    Engineered living materials based on adhesin-mediated trapping of programmable cells

    Guo, S., Dubuc, E., Rave, Y., Verhagen, M., Twisk, S. A. E., van der Hek, T., Oerlemans, G. J. M., van den Oetelaar, M. C. M., van Hazendonk, L. S., Brüls, M., Eijkens, B. V., Joostens, P. L., Keij, S. R., Xing, W., Nijs, M., Stalpers, J., Sharma, M., Gerth, M., Boonen, R. J. E. A., Verduin, K. & 3 anderen, Merkx, M., Voets, I. K. & De Greef, T. F. A., 20 mrt 2020, In : ACS Synthetic Biology. 9, 3, blz. 475-485 11 blz.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

    Open Access
    Bestand
  • 1 Downloads (Pure)

    Metabolic Health Index (MHI): assessment of comorbidity in bariatric patients based on biomarkers

    van Loon, S. L. M., Deneer, R., Nienhuijs, S. W., Wilbik, A., Kaymak, U., van Riel, N., Scharnhorst, V. & Boer, A-K., 1 feb 2020, In : Obesity Surgery. 30, 2, blz. 714-724 11 blz.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

  • Model-based data analysis of individual human postprandial plasma bile acid responses indicates a major role for the gallbladder and intestine

    Meessen, E. C. E., Sips, F. L. P., Eggink, H. M., Koehorst, M., Romijn, J. A., Groen, A. K., van Riel, N. A. W. & Soeters, M. R., 1 mrt 2020, In : Physiological Reports. 8, 5, 14 blz., e14358.

    Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschriftTijdschriftartikelAcademicpeer review

    Open Access
    Bestand
  • 3 Downloads (Pure)

    Prijzen

    AMC Principal Investigator

    Natal van Riel (Ontvanger), 1 mei 2016

    Prijs: AndersWerk, activiteit of publicatie gerelateerde prijzen (lifetime, best paper, poster etc.)Wetenschappelijk

    Best poster award

    Yvonne Rozendaal (Ontvanger), 28 okt 2016

    Prijs: AndersWerk, activiteit of publicatie gerelateerde prijzen (lifetime, best paper, poster etc.)Wetenschappelijk

  • Activiteiten

    Personalized modelling of bile acid metabolism: predicting metabolic effects of bariatric surgery

    Natal van Riel (Spreker)
    6 jul 2018

    Activiteit: Types gesprekken of presentatiesGenodigd sprekerWetenschappelijk

    A physiology based glucose-insulin-GLP-1 model: explaining changes observed after Roux-en-Y gastric bypass

    L.C.P. Thijssen (Spreker), Natal van Riel (Deelnemer)
    15 mei 2018

    Activiteit: Types gesprekken of presentatiesAangemelde presentatieWetenschappelijk

    4th Dutch Bioinformatics & Systems Biology Conference

    Natal van Riel (Organisator)
    15 mei 201816 mei 2018

    Activiteit: Types deelname aan of organisatie van een evenementCongresWetenschappelijk

    Knipsels

    THE YOUNG ACADEMY WELCOMES TEN NEW MEMBERS

    Tom F.A. de Greef & Liesbeth M.C. Janssen

    10/12/19

    1 item van Media-aandacht

    Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar

    Young Academy welcomes Liesbeth Janssen

    Carlijn V.C. Bouten & Tom F.A. de Greef

    10/12/19

    1 item van Media-aandacht

    Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar

    Professor Maarten Merkx new Dean of the Department of Biomedical Engineering

    Peter A.J. Hilbers

    21/10/19

    1 item van Media-aandacht

    Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar

    Impacts

    Bioinformatics and Mathematical Modelling

    Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)

    Impact: Research Topic/Theme (at group level)

    Brain Image Analysis

    Josien P.W. Pluim (Content manager), Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)

    Impact: Research Topic/Theme (at group level)

    Cardiovascular Image Analysis

    Josien P.W. Pluim (Content manager), Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)

    Impact: Research Topic/Theme (at group level)

    Scripties/Masterproeven

    A computational biology framework: a data analysis tool to support biomedical engineers in their research

    Auteur: Beishuizen, T., 29 nov 2018

    Begeleider: Bosnacki, D. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2), Fletcher, G. (Afstudeerdocent 2) & Vanschoren, J. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master

    A physiology based glucose-insulin-GLP-1 model: explaining changes observed after Roux-en-Y gastric bypass

    Auteur: Thijssen, L., 30 aug 2018

    Begeleider: Sips, F. (Afstudeerdocent 1), Yildirim, V. (Afstudeerdocent 2), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2) & Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master

    Biomarkers as predictor of quality of life in bariatric patients

    Auteur: Schouten, J., 31 jan 2019

    Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2), Scharnhorst, V. (Afstudeerdocent 2), van Loon, S. (Afstudeerdocent 2) & Deneer, R. (Afstudeerdocent 2)

    Scriptie/masterproef: Master