Projecten per jaar
Organisatieprofiel
Introductie / missie
Constructing computational models to improve the knowledge of diseases, biomedical processes and structures
Highlighted phrase
Describing, understanding and ultimately controlling life's processes
Over de organisatie
The research group Computational Biology develops computational models that help to obtain qualitative and quantitative knowledge of diseases, biomedical processes and structures. The computational models are developed based on a thorough understanding of molecular modeling methods, data analysis techniques, machine learning, systems biology, and parameter estimation techniques. Next to data obtained through collaborations and partnerships with other university groups, companies and hospitals, within the Synthetic Biology arena data is also achieved by own experiments. Topics of research are, amongst others, biomembranes, protein interactions, complex biochemical networks, and diseases like metabolic syndrome, diabetes mellitus and cancer. The group also puts efforts in enhancing the shift from ‘describing’ life’s processes to ‘understanding’ them and ‘capturing’ them in validated predictive models, and even ‘managing’ or ‘controlling’ them in real life. Research themes of the group are Molecular Simulations, Systems Biology, Synthetic Biology, Bioinformatics and Mathematical Modeling.
Vingerafdruk Verdiep u in de onderzoeksgebieden waarop Computational Biology actief is. Deze onderwerplabels komen uit het werk van de leden van deze organisatie. Samen vormen ze een unieke vingerafdruk.
Netwerk
Recente externe samenwerking op landenniveau. Duik in de details door op de stippen te klikken.
Profielen
Gizem Aktas, MSc
- Faculteit Biomedische Technologie, Computational Biology - Promovendus
Persoon: Prom. : Promovendus
Mart Bartelds, MSc
- Faculteit Biomedische Technologie, Computational Biology - Onderzoeker
Persoon: OWP : Docent / Onderzoeker
Bas Bögels
- Faculteit Biomedische Technologie, Computational Biology - Promovendus
- Faculteit Biomedische Technologie, Chemical Biology - Promovendus
Persoon: Prom. : Promovendus
projecten
- 1 Actief
NWO/Complexity/MATRyOSka
van Riel, N. A. W., Aktas, G., O'Donovan, S. D., Arts, I. C. W. & Afman, L.
1/10/17 → 31/12/22
Project: Onderzoek direct
Onderzoeksoutput
Engineered living materials based on adhesin-mediated trapping of programmable cells
Guo, S., Dubuc, E., Rave, Y., Verhagen, M., Twisk, S. A. E., van der Hek, T., Oerlemans, G. J. M., van den Oetelaar, M. C. M., van Hazendonk, L. S., Brüls, M., Eijkens, B. V., Joostens, P. L., Keij, S. R., Xing, W., Nijs, M., Stalpers, J., Sharma, M., Gerth, M., Boonen, R. J. E. A., Verduin, K. & 3 anderen, , 20 mrt 2020, In : ACS Synthetic Biology. 9, 3, blz. 475-485 11 blz.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Tijdschriftartikel › Academic › peer review
Open Access
Bestand
Metabolic Health Index (MHI): assessment of comorbidity in bariatric patients based on biomarkers
van Loon, S. L. M., Deneer, R., Nienhuijs, S. W., Wilbik, A., Kaymak, U., van Riel, N., Scharnhorst, V. & Boer, A-K., 1 feb 2020, In : Obesity Surgery. 30, 2, blz. 714-724 11 blz.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Tijdschriftartikel › Academic › peer review
Model-based data analysis of individual human postprandial plasma bile acid responses indicates a major role for the gallbladder and intestine
Meessen, E. C. E., Sips, F. L. P., Eggink, H. M., Koehorst, M., Romijn, J. A., Groen, A. K., van Riel, N. A. W. & Soeters, M. R., 1 mrt 2020, In : Physiological Reports. 8, 5, 14 blz., e14358.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Tijdschriftartikel › Academic › peer review
Open Access
Bestand
Prijzen
AMC Principal Investigator
Natal van Riel (Ontvanger), 1 mei 2016
Prijs: Anders › Werk, activiteit of publicatie gerelateerde prijzen (lifetime, best paper, poster etc.) › Wetenschappelijk
Best poster award
Yvonne Rozendaal (Ontvanger), 28 okt 2016
Prijs: Anders › Werk, activiteit of publicatie gerelateerde prijzen (lifetime, best paper, poster etc.) › Wetenschappelijk
COST Action BM1402: Development of a European network for preclinical testing of interventions in mouse models of age and age-related diseases (MouseAGE)
Natal van Riel (Ontvanger), 1 dec 2014
Prijs: Anders › Discipline gerelateerd › Wetenschappelijk
Activiteiten
Personalized modelling of bile acid metabolism: predicting metabolic effects of bariatric surgery
Natal van Riel (Spreker)6 jul 2018
Activiteit: Types gesprekken of presentaties › Genodigd spreker › Wetenschappelijk
A physiology based glucose-insulin-GLP-1 model: explaining changes observed after Roux-en-Y gastric bypass
L.C.P. Thijssen (Spreker), Natal van Riel (Deelnemer)15 mei 2018
Activiteit: Types gesprekken of presentaties › Aangemelde presentatie › Wetenschappelijk
4th Dutch Bioinformatics & Systems Biology Conference
Natal van Riel (Organisator)15 mei 2018 → 16 mei 2018
Activiteit: Types deelname aan of organisatie van een evenement › Congres › Wetenschappelijk
Knipsels
THE YOUNG ACADEMY WELCOMES TEN NEW MEMBERS
Tom F.A. de Greef & Liesbeth M.C. Janssen
10/12/19
1 item van Media-aandacht
Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar
Young Academy welcomes Liesbeth Janssen
Carlijn V.C. Bouten & Tom F.A. de Greef
10/12/19
1 item van Media-aandacht
Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar
Professor Maarten Merkx new Dean of the Department of Biomedical Engineering
21/10/19
1 item van Media-aandacht
Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar
Impacts
Bioinformatics and Mathematical Modelling
Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)
Impact: Research Topic/Theme (at group level)
Brain Image Analysis
Josien P.W. Pluim (Content manager), Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)
Impact: Research Topic/Theme (at group level)
Cardiovascular Image Analysis
Josien P.W. Pluim (Content manager), Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)
Impact: Research Topic/Theme (at group level)
Scripties/Masterproeven
A computational biology framework: a data analysis tool to support biomedical engineers in their research
Auteur: Beishuizen, T., 29 nov 2018Begeleider: Bosnacki, D. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2), Fletcher, G. (Afstudeerdocent 2) & Vanschoren, J. (Afstudeerdocent 2)
Scriptie/masterproef: Master
A physiology based glucose-insulin-GLP-1 model: explaining changes observed after Roux-en-Y gastric bypass
Auteur: Thijssen, L., 30 aug 2018Begeleider: Sips, F. (Afstudeerdocent 1), Yildirim, V. (Afstudeerdocent 2), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2) & Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2)
Scriptie/masterproef: Master
Biomarkers as predictor of quality of life in bariatric patients
Auteur: Schouten, J., 31 jan 2019Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2), Scharnhorst, V. (Afstudeerdocent 2), van Loon, S. (Afstudeerdocent 2) & Deneer, R. (Afstudeerdocent 2)
Scriptie/masterproef: Master