Onderzoeksoutput per jaar
Organisatieprofiel
Introductie / missie
Constructing computational models to improve the knowledge of diseases, biomedical processes and structures
Highlighted phrase
Describing, understanding and ultimately controlling life's processes
Over de organisatie
The research group Computational Biology develops computational models that help to obtain qualitative and quantitative knowledge of diseases, biomedical processes and structures. The computational models are developed based on a thorough understanding of molecular modeling methods, data analysis techniques, machine learning, systems biology, and parameter estimation techniques. Next to data obtained through collaborations and partnerships with other university groups, companies and hospitals, within the Synthetic Biology arena data is also achieved by own experiments. Topics of research are, amongst others, biomembranes, protein interactions, complex biochemical networks, and diseases like metabolic syndrome, diabetes mellitus and cancer. The group also puts efforts in enhancing the shift from ‘describing’ life’s processes to ‘understanding’ them and ‘capturing’ them in validated predictive models, and even ‘managing’ or ‘controlling’ them in real life. Research themes of the group are Molecular Simulations, Systems Biology, Synthetic Biology, Bioinformatics and Mathematical Modeling.
Vingerafdruk Duik in de onderzoeksthema's waar Computational Biology actief is. Deze onderwerplabels komen voort uit het werk van deze leden van de organisatie. Samen vormen ze een unieke vingerafdruk.
Model checking
Engineering en materiaalwetenschappen
Polymers
Chemische stoffen
Self assembly
Chemische stoffen
Computer Simulation
Medicijnen en Levenswetenschappen
Systems Biology
Medicijnen en Levenswetenschappen
Monomers
Chemische stoffen
Muscles
Medicijnen en Levenswetenschappen
Polymerization
Chemische stoffen
Netwerk
Recente externe samenwerking op landenniveau. Duik in de details door op de stippen te klikken.
Profielen
Gizem Aktas, MSc
- Faculteit Biomedische Technologie, Computational Biology - Promovendus
Persoon: Prom. : Promovendus
Mart Bartelds, MSc
- Faculteit Biomedische Technologie, Computational Biology - Onderzoeker
Persoon: OWP : Docent / Onderzoeker
Bas Bögels
- Faculteit Biomedische Technologie, Computational Biology - Promovendus
- Faculteit Biomedische Technologie, Chemical Biology - Promovendus
Persoon: Prom. : Promovendus
Onderzoeksoutput 1982 2019
A computational model of postprandial adipose tissue lipid metabolism derived using human arteriovenous stable isotope tracer data
O'Donovan, S. D., Lenz, M., Vink, R. G., Roumans, N. J. T., de Kok, T. M. C. M., Mariman, E. C. M., Peeters, R. L. M., van Riel, N. A. W., van Baak, M. A. & Arts, I. C. W., 3 okt 2019, In : PLoS Computational Biology. 15, 10, 23 blz., e1007400.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Tijdschriftartikel › Academic › peer review
Open Access
Lipid Metabolism
Radioactive tracers
isotope labeling
Isotopes
lipid metabolism
A DNA-based synthetic apoptosome
Rosier, B., Markvoort, B., Gumi Audenis, B., Roodhuizen, J., Brunsveld, L. & de Greef, T. F. A., 2019, (Geaccepteerd/In druk) In : Nature Catalysis.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Tijdschriftartikel › Academic › peer review
Open Access
Apoptosomes
Caspase 9
DNA
Proteins
Enzymes
A multilayer microfluidic platform for the conduction of prolonged cell-free gene expression
van der Linden, A., Pieters, P., Yelleswarapu, M., Swank, Z., Huck, W. T. S., Maerkl, S. & de Greef, T., 1 okt 2019, In : Journal of Visualized Experiments (JoVE). 152, 14 blz., e59655.Onderzoeksoutput: Bijdrage aan tijdschrift › Tijdschriftartikel › Academic › peer review
Open Access
Bestand
Lab-On-A-Chip Devices
Microfluidics
Transcription
Gene expression
Multilayers
Prijzen
AMC Principal Investigator
Natal van Riel (Ontvanger), 1 mei 2016
Prijs: Anders › Werk, activiteit of publicatie gerelateerde prijzen (lifetime, best paper, poster etc.) › Wetenschappelijk
Best poster award
Yvonne Rozendaal (Ontvanger), 28 okt 2016
Prijs: Anders › Werk, activiteit of publicatie gerelateerde prijzen (lifetime, best paper, poster etc.) › Wetenschappelijk
COST Action BM1402: Development of a European network for preclinical testing of interventions in mouse models of age and age-related diseases (MouseAGE)
Natal van Riel (Ontvanger), 1 dec 2014
Prijs: Anders › Discipline gerelateerd › Wetenschappelijk
Heart Neoplasms
Practice Guidelines
Chronic Disease
Stroke
Myocardial Infarction
Activiteiten 1999 2018
Personalized modelling of bile acid metabolism: predicting metabolic effects of bariatric surgery
Natal van Riel (Spreker)6 jul 2018
Activiteit: Types gesprekken of presentaties › Genodigd spreker › Wetenschappelijk
A physiology based glucose-insulin-GLP-1 model: explaining changes observed after Roux-en-Y gastric bypass
L.C.P. Thijssen (Spreker), Natal van Riel (Deelnemer)15 mei 2018
Activiteit: Types gesprekken of presentaties › Aangemelde presentatie › Wetenschappelijk
4th Dutch Bioinformatics & Systems Biology Conference
Natal van Riel (Organisator)15 mei 2018 → 16 mei 2018
Activiteit: Types deelname aan of organisatie van een evenement › Congres › Wetenschappelijk
Pers/media
Young Academy welcomes Liesbeth Janssen
Carlijn V.C. Bouten & Tom F.A. de Greef
10/12/19
1 item van Media-aandacht
Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar
Professor Maarten Merkx new Dean of the Department of Biomedical Engineering at TU/e
Frank P.T. Baaijens, Peter A.J. Hilbers, Maarten Merkx, Keita Ito & Josien P.W. Pluim
21/10/19
1 item van Media-aandacht
Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar
Virtual Patients Help Improve Blue Light Treatment for Psoriasis
Natal A.W. van Riel & Peter A.J. Hilbers
13/08/19
1 item van Media-aandacht
Pers / media: Vakinhoudelijk commentaar
Impacts
Bioinformatics and Mathematical Modelling
Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)
Impact: Research Topic/Theme (at group level)
Brain Image Analysis
Josien P.W. Pluim (Content manager), Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)
Impact: Research Topic/Theme (at group level)
Cardiovascular Image Analysis
Josien P.W. Pluim (Content manager), Rina van Dijck - Postma (Content manager), Sylvia van Beek - Verschure (Content manager), Lieke van Gorp (Content manager), Amy Broeders (Content manager)
Impact: Research Topic/Theme (at group level)
Scripties/masterproeven
A computational biology framework: a data analysis tool to support biomedical engineers in their research
Auteur: Beishuizen, T., 29 nov 2018Begeleider: Bosnacki, D. (Afstudeerdocent 1), Cheplygina, V. (Afstudeerdocent 2), Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2), Fletcher, G. (Afstudeerdocent 2) & Vanschoren, J. (Afstudeerdocent 2)
Scriptie/masterproef: Master
A physiology based glucose-insulin-GLP-1 model: explaining changes observed after Roux-en-Y gastric bypass
Auteur: Thijssen, L., 30 aug 2018Begeleider: Sips, F. (Afstudeerdocent 1), Yildirim, V. (Afstudeerdocent 2), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2) & Hilbers, P. (Afstudeerdocent 2)
Scriptie/masterproef: Master
Biomarkers as predictor of quality of life in bariatric patients
Auteur: Schouten, J., 31 jan 2019Begeleider: Hilbers, P. (Afstudeerdocent 1), van Riel, N. (Afstudeerdocent 2), Scharnhorst, V. (Afstudeerdocent 2), van Loon, S. (Afstudeerdocent 2) & Deneer, R. (Afstudeerdocent 2)
Scriptie/masterproef: Master