Biomedical Engineering

Zoekresultaten

• RoA: visual analytics support for deconfounded causal inference in observational studies

  Dingen, D. (Ontwerper), Bakkes, T. (Bijdrager), van 't Veer, M. (Bijdrager), Korsten, H. H. M. (Bijdrager), Bouwman, R. A. (Bijdrager) & van Wijk, J. J. (Bijdrager), Zenodo, 19 mei 2023

  DOI: 10.5281/zenodo.11518056, https://zenodo.org/records/11518056

  Dataset

• Data underlying the publication: Computational analysis of heart valve growth and remodeling after the Ross procedure

  Middendorp, E. (Ontwerper), Braeu, F. (Ontwerper), Baaijens, F. P. T. (Ontwerper), Humphrey, J. D. (Ontwerper), Cyron, C. J. (Ontwerper) & Loerakker, S. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 1 sep. 2024

  DOI: 10.4121/0d75d445-0f1a-4e92-9b80-bec9afc10556, https://data.4tu.nl/datasets/0d75d445-0f1a-4e92-9b80-bec9afc10556 en nog één link, https://data.4tu.nl/datasets/0d75d445-0f1a-4e92-9b80-bec9afc10556/1 (minder tonen)

  Dataset

• EDES1.0

  van Riel, N. A. W. (Ontwerper), EMBL-EBI, 7 mrt. 2024

  https://www.ebi.ac.uk/biomodels/MODEL2403070001

  Dataset

• Fluorescence microscopy, image analysis and quantitative PCR data underlying the publication “Engineered patterns of Notch ligands Jag1 and Dll4 elicit differential spatial control of endothelial sprouting”

  Tiemeijer, L. A. (Ontwerper), Ristori, T. (Ontwerper), Stassen, O. M. J. A. (Ontwerper), Ahlberg, J. J. (Ontwerper), de Bijl, J. J. J. (Ontwerper), Chen, C. S. (Ontwerper), Bentley, K. (Ontwerper), Bouten, C. V. C. (Ontwerper) & Sahlgren, C. M. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 6 mei 2022

  DOI: 10.4121/19235784, https://data.4tu.nl/articles/_/19235784

  Dataset

• MIDOG++ database in SlideRunner sqlite format

  Aubreville, M. (Ontwerper), Wilm, F. (Ontwerper), Stathonikos, N. (Ontwerper), Breininger, K. (Ontwerper), Donovan, T. (Ontwerper), Jabari, S. (Ontwerper), Veta, M. (Ontwerper), Ammeling, J. (Ontwerper), van Diest, P. J. (Ontwerper), Klopfleisch, R. (Ontwerper) & Bertram, C. A. (Ontwerper), Figshare, 30 jun. 2023

  DOI: 10.6084/m9.figshare.23531118, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/MIDOG_database_in_SlideRunner_sqlite_format/23531118 en nog één link, https://springernature.figshare.com/articles/dataset/MIDOG_database_in_SlideRunner_sqlite_format/23531118/1 (minder tonen)

  Dataset

• Functional mapping of androgen receptor enhancer activity

  Zwart, W. (Ontwerper), Linder, S. (Ontwerper), Huang, C.-C. F. (Ontwerper), Le Bihan, S. (Bijdrager), Hach, F. (Bijdrager), Altintas, U. B. (Ontwerper), Lack, N. A. (Ontwerper), Ozturan, D. (Bijdrager), Collins, C. (Ontwerper), Gokbayrak, B. (Bijdrager), Hoogstraat, M. (Ontwerper), Saffarzadeh, M. (Bijdrager), Sar, F. (Ontwerper), Bergman, A. M. (Ontwerper), Stelloo, S. (Ontwerper), Lingadahalli, S. (Bijdrager), Gleave, M. E. (Ontwerper), van der Poel, H. (Bijdrager), Morova, T. (Bijdrager), McConeghy, B. (Ontwerper), Hu, E. (Ontwerper), Yu, I. P. L. (Ontwerper), Feng, F. Y. (Ontwerper) & Emberly, E. (Ontwerper), Figshare, 12 mei 2021

  DOI: 10.6084/m9.figshare.c.5421005, https://springernature.figshare.com/collections/Functional_mapping_of_androgen_receptor_enhancer_activity/5421005

  Dataset

• Mechanotransduction is a context-dependent activator of TGF-β signaling in mesenchymal stem cells

  Vermeulen, S. A. A. (Ontwerper), de Boer, J. (Bijdrager) & Hebels, D. (Bijdrager), DataverseNL, 18 aug. 2020

  DOI: 10.34894/vvatm8, https://dataverse.nl/citation?persistentId=doi:10.34894/VVATM8

  Dataset

• Micro-topographies induce epigenetic reprogramming and quiescence in human mesenchymal stem cells

  Vermeulen, S. A. A. (Ontwerper), de Boer, J. (Ontwerper) & Hebels, D. G. A. J. (Bijdrager), DataverseNL, 7 nov. 2022

  DOI: 10.34894/s2qx6c, https://dataverse.nl/citation?persistentId=doi:10.34894/S2QX6C

  Dataset

• Characterization of disease-specific cellular abundance profiles of chronic inflammatory skin conditions from deconvolution of biopsy samples

  Félix Garza, Z. C. (Bijdrager), Lenz, M. (Ontwerper), Liebmann, J. (Bijdrager), Ertaylan, G. (Bijdrager), Born, M. (Ontwerper), Arts, I. C. W. (Ontwerper), Hilbers, P. A. J. (Ontwerper) & van Riel, N. A. W. (Bijdrager), Figshare, 17 aug. 2019

  DOI: 10.6084/m9.figshare.c.4621205, https://springernature.figshare.com/collections/Characterization_of_disease-specific_cellular_abundance_profiles_of_chronic_inflammatory_skin_conditions_from_deconvolution_of_biopsy_samples/4621205 en nog één link, https://springernature.figshare.com/collections/Characterization_of_disease-specific_cellular_abundance_profiles_of_chronic_inflammatory_skin_conditions_from_deconvolution_of_biopsy_samples/4621205/1 (minder tonen)

  Dataset

• CCDC 1517934: Experimental Crystal Structure Determination

  Wang, Y. (Ontwerper), Fang, H. (Ontwerper), Tranca, I. (Ontwerper), Qu, H. (Ontwerper), Wang, X. (Ontwerper), Markvoort, A. J. (Ontwerper), Tian, Z. (Ontwerper) & Cao, X. (Ontwerper), Cambridge Crystallographic Data Centre, 18 nov. 2016

  DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc1myjmq, http://www.ccdc.cam.ac.uk/services/structure_request?id=doi:10.5517/ccdc.csd.cc1myjmq&sid=DataCite

  Dataset

• Computational code underlying the publication “Engineered patterns of Notch ligands Jag1 and Dll4 elicit differential spatial control of endothelial sprouting”

  Tiemeijer, L. A. (Ontwerper), Ristori, T. (Ontwerper), Stassen, O. M. J. A. (Ontwerper), Ahlberg, J. J. (Ontwerper), de Bijl, J. J. J. (Ontwerper), Chen, C. S. (Ontwerper), Bentley, K. (Ontwerper), Bouten, C. V. C. (Ontwerper) & Sahlgren, C. M. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 6 mei 2022

  DOI: 10.4121/19235793, https://data.4tu.nl/articles/_/19235793

  Dataset

• Limited evidence for return to sport testing after ACL reconstruction in children and adolescents under 16 years: a scoping review

  Dietvorst, M. (Ontwerper), Brzoskowski, M. H. (Ontwerper), van der Steen, M. (Bijdrager), Delvaux, E. (Ontwerper), Janssen, R. P. A. (Ontwerper) & Engelen-van Melick, N. (Bijdrager), Figshare, 16 okt. 2020

  DOI: 10.6084/m9.figshare.c.5176960, https://springernature.figshare.com/collections/Limited_evidence_for_return_to_sport_testing_after_ACL_reconstruction_in_children_and_adolescents_under_16_years_a_scoping_review/5176960

  Dataset

• An automated algorithm for the detection of cortical interruptions and its underlying loss of trabecular bone; a reproducibility study

  Peters, M. P. H. (Bijdrager), de Jong, J. J. A. (Bijdrager), Scharmga, A. (Bijdrager), van Tubergen, A. (Bijdrager), Geusens, P. (Bijdrager), Loeffen, D. (Bijdrager), Weijers, R. (Bijdrager), Boyd, S. K. (Bijdrager), Barnabe, C. (Bijdrager), Stok, K. S. (Bijdrager), van Rietbergen, B. (Bijdrager) & van den Bergh, J. (Bijdrager), Figshare, 15 mei 2018

  DOI: 10.6084/m9.figshare.c.4101566, https://figshare.com/collections/An_automated_algorithm_for_the_detection_of_cortical_interruptions_and_its_underlying_loss_of_trabecular_bone_a_reproducibility_study/4101566 en nog één link, https://figshare.com/collections/An_automated_algorithm_for_the_detection_of_cortical_interruptions_and_its_underlying_loss_of_trabecular_bone_a_reproducibility_study/4101566/1 (minder tonen)

  Dataset

• Additional file 4 of Identifying potential patient-specific predictors for anterior cruciate ligament reconstruction outcome – a diagnostic in vitro tissue remodeling platform

  van Vijven, M. (Bijdrager), van Groningen, B. (Bijdrager), Kimenai, J. N. (Ontwerper), van der Steen, M. C. (Bijdrager), van Doeselaar, M. (Bijdrager), Janssen, R. P. A. (Ontwerper), Ito, K. (Ontwerper) & Foolen, J. (Ontwerper), Figshare, 5 jul. 2020

  DOI: 10.6084/m9.figshare.12611690

  Dataset

• Additional file 2 of Identifying potential patient-specific predictors for anterior cruciate ligament reconstruction outcome – a diagnostic in vitro tissue remodeling platform

  van Vijven, M. (Bijdrager), van Groningen, B. (Bijdrager), Kimenai, J. N. (Ontwerper), van der Steen, M. C. (Bijdrager), van Doeselaar, M. (Bijdrager), Janssen, R. P. A. (Ontwerper), Ito, K. (Ontwerper) & Foolen, J. (Ontwerper), Figshare, 5 jul. 2020

  DOI: 10.6084/m9.figshare.12611684, https://springernature.figshare.com/articles/Additional_file_2_of_Identifying_potential_patient-specific_predictors_for_anterior_cruciate_ligament_reconstruction_outcome_a_diagnostic_in_vitro_tissue_remodeling_platform/12611684

  Dataset

• In vivo imaging of cerebral glucose metabolism informs on subacute to chronic post-stroke tissue status – A pilot study combining PET and deuterium metabolic imaging

  Meerwaldt, A. E. (Ontwerper), Straathof, M. (Ontwerper), Oosterveld, W. (Ontwerper), van Heijningen, C. L. (Ontwerper), van Leent, M. M. T. (Ontwerper), Toner, Y. C. (Ontwerper), Munitz, J. (Ontwerper), Teunissen, A. J. P. (Ontwerper), Daemen, C. C. (Ontwerper), van der Toorn, A. (Ontwerper), van Vliet, G. (Ontwerper), van Tilborg, G. A. F. (Ontwerper), De Feyter, H. M. M. L. (Ontwerper), de Graaf, R. A. (Ontwerper), Hol, E. M. (Ontwerper), Mulder, W. J. M. (Ontwerper) & Dijkhuizen, R. M. (Ontwerper), SAGE Journals, 7 jan. 2023

  DOI: 10.25384/sage.c.6374440

  Dataset

• The impact of shape uncertainty on aortic-valve pressure-drop computations: supplementary data files

  Hoeijmakers, M. J. M. M. (Ontwerper), Huberts, W. (Ontwerper), Rutten, M. C. M. (Ontwerper) & van de Vosse, F. N. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 11 aug. 2021

  DOI: 10.4121/15043599, https://data.4tu.nl/articles/_/15043599

  Dataset

• Androgen receptor reprogramming demarcates prognostic, context-dependent gene sets in primary and metastatic prostate cancer

  Severson, T. (Ontwerper), Qiu, X. (Ontwerper), Alshalalfa, M. (Ontwerper), Sjöström, M. (Ontwerper), Quigley, D. (Ontwerper), Bergman, A. (Ontwerper), Long, H. (Ontwerper), Feng, F. (Ontwerper), Freedman, M. L. (Ontwerper), Zwart, W. (Ontwerper) & Pomerantz, M. M. (Ontwerper), Figshare, 5 mei 2022

  DOI: 10.6084/m9.figshare.c.5980409, https://springernature.figshare.com/collections/Androgen_receptor_reprogramming_demarcates_prognostic_context-dependent_gene_sets_in_primary_and_metastatic_prostate_cancer/5980409

  Dataset

• DNA-PAINT super-resolution imaging data of surface exposed active sites on particles - Revised

  Delcanale, P. (Ontwerper) & Albertazzi, L. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 16 mrt. 2020

  DOI: 10.4121/uuid:50bd0ad4-52d8-4138-8eb1-40b4d7fc2286

  Dataset

• Additional file 7: of An automated algorithm for the detection of cortical interruptions and its underlying loss of trabecular bone; a reproducibility study

  Peters, M. (Bijdrager), de Jong, J. J. A. (Bijdrager), Scharmga, A. (Bijdrager), van Tubergen, A. M. (Bijdrager), Geusens, P. (Bijdrager), Loeffen, D. (Bijdrager), Weijers, R. (Bijdrager), Boyd, S. K. (Bijdrager), Barnabe, C. (Bijdrager), Stok, K. S. (Bijdrager), van Rietbergen, B. (Bijdrager) & van den Bergh, J. (Bijdrager), Figshare, 15 mei 2018

  DOI: 10.6084/m9.figshare.6274355, https://springernature.figshare.com/articles/Additional_file_7_of_An_automated_algorithm_for_the_detection_of_cortical_interruptions_and_its_underlying_loss_of_trabecular_bone_a_reproducibility_study/6274355 en nog één link, https://springernature.figshare.com/articles/Additional_file_7_of_An_automated_algorithm_for_the_detection_of_cortical_interruptions_and_its_underlying_loss_of_trabecular_bone_a_reproducibility_study/6274355/1 (minder tonen)

  Dataset

• Permeability of the windows of the brain: feasibility of dynamic contrast-enhanced MRI of the circumventricular organs

  Verheggen, I. C. M. (Ontwerper), de Jong, J. J. A. (Ontwerper), van Boxtel, M. P. J. (Ontwerper), Postma, A. A. (Ontwerper), Verhey, F. R. J. (Ontwerper), Jansen, J. F. A. (Ontwerper) & Backes, W. H. (Ontwerper), Figshare, 17 nov. 2021

  DOI: 10.6084/m9.figshare.c.5190869, https://springernature.figshare.com/collections/Permeability_of_the_windows_of_the_brain_feasibility_of_dynamic_contrast-enhanced_MRI_of_the_circumventricular_organs/5190869

  Dataset

• CCDC 2183726: Experimental Crystal Structure Determination

  Maurya, G. P. (Bijdrager), Verma, D. (Bijdrager), Sinha, A. (Bijdrager), Brunsveld, L. (Bijdrager) & Haridas, V. (Bijdrager), Cambridge Crystallographic Data Centre, 7 apr. 2022

  DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2c9bst

  Dataset

• Cryo-TEM raw data underlying the publication: Polymersomes with splenic avidity target red pulp myeloid cells for cancer immunotherapy

  Wauters, A. C. (Ontwerper), Scheerstra, J. F. (Ontwerper) & van Hest, J. C. M. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 31 jul. 2024

  DOI: 10.4121/4f8c02c7-9787-435c-a9b2-1adc3af5dd22, https://data.4tu.nl/datasets/4f8c02c7-9787-435c-a9b2-1adc3af5dd22 en nog één link, https://data.4tu.nl/datasets/4f8c02c7-9787-435c-a9b2-1adc3af5dd22/1 (minder tonen)

  Dataset

• CCDC 2183727: Experimental Crystal Structure Determination

  Maurya, G. P. (Bijdrager), Verma, D. (Bijdrager), Sinha, A. (Bijdrager), Brunsveld, L. (Bijdrager) & Haridas, V. (Bijdrager), Cambridge Crystallographic Data Centre, 7 apr. 2022

  DOI: 10.5517/ccdc.csd.cc2c9btv

  Dataset

• Data belonging to the publication: "Computational analysis of the role of mechanosensitive Notch signaling in arterial adaptation to hypertension"

  van Asten, J. G. M. (Bijdrager), Ristori, T. (Ontwerper), Nolan, D. R. (Ontwerper), Lally, C. (Ontwerper), Baaijens, F. P. T. (Ontwerper), Sahlgren, C. M. (Ontwerper) & Loerakker, S. (Ontwerper), 4TU.Centre for Research Data, 7 jul. 2022

  DOI: 10.4121/20237562, https://data.4tu.nl/articles/_/20237562

  Dataset